Нет, петля Roux и билиопанкреатическая петля не синонимы.
Существуют три петли (при ЖШ и БПШ):
1. Петля Roux - идет к желудочно-кишечному анастомозу. По ней движется только пища. Поэтому ее иногда называют алиментарной петлей.
2. Билиопанкреатическая петля - по ней движутся желчь и сок поджелудочной железы (поэтому она и называется билиопанкреатической)
3. Общая петля - от межкишечного анастомоза по толстой кишки. Пища и желчь движутся по ней совместно (поэтому она и "общая")
На схеме, взятой из цитируемой статьи, сделаны обозначения.