При гастроскопии осматривают пищевод, желудок и начальный отдел 12-перстной кишки. А червь в желудке не живет, поскольку там ему будет некомфортно - там концентрированная соляная кислота. Он живет глубоко в тонкой кишке, где условия не такие экстремальные. А тонкую кишку при стандартной гастроскопии осмотреть не удается.